はい、含まれています。事故車の場合でも再利用可能な中古部品は取外します。年式が新しい事故車の場合は査定金額も変わります。
たとえ事故車で、大きくキズついたりへこんだりしていても、その素材には変わりありません。事故をしている事で素材分別は作業工数が増えますが、リサイクル可能な素材の数は変わりませんので、自動車のリサイクルには、事故車も含みます。